Vue не работает фильтр uppercase

Просто используйте вызов напрямую

{{ message.toUpperCase() }}

Если это всё, что действительно вам нужно.

Во Vue нет встроенных фильтров, создайте свой:

new Vue({
    el: '#app',
    data: {
        message: 'uppercase'
    },
    filters: {
        uppercase: (value) => value.toUppercase()
    }
});

Либо используйте эту же функцию в шаблоне:

<div id="app">{{ message.toUppercase() }}</div>