Бэкап только новых данных MySQL

Возможное решение.

1a. Выполняется дамп структуры БД, без данных. Например, с помощью утилиты mysqldump, запускаемой с ключом --no-data.

1b. Выполняется полное резервное копирование данных таблиц, каждой таблицы отдельно, с помощью SQL-запроса SELECT .. INTO OUTFILE.

либо

1. Выполняется дамп структуры БД, вместе с данными. Например, с помощью утилиты mysqldump

В дальнейшем

2. Выполняется инкрементное резервное копирование данных таблиц, каждой таблицы отдельно, с помощью SQL-запроса SELECT .. INTO OUTFILE. Отбор копируемых данных выполняется в секции WHERE запроса - по значению штампа времени изменения записи либо по значению синтетического автоинкрементного ключа. Сведения о штампе времени или автоинкременте для копированных ранее записей для каждой таблицы можно хранить в служебной таблице той же или служебной БД либо вовне.