Механизм работы COUNT() в MySQL

SELECT COUNT(*) FROM ( SELECT DISTINCT phone FROM registered_phones ) t;

Выбрать phone, отбросить повторяющиеся и подсчитать количество оставшихся

SELECT DISTINCT phone, count(phone) FROM registered_phones;

Для всех записей вывести значения поля phone и количество записей в таблице, где phone IS NOT NULL. Из пар (phone, count) отбросить дубликаты

1. Потому что группируем по строке и смотрим, сколько раз она встречается

   SELECT *, COUNT(phone) 
   FROM registered_phones
   GROUP BY phone
   HAVING COUNT(1) > 1
   

2. Что мешает для поиска неповторяющихся значений написать так?

   SELECT *, COUNT(phone) 
   FROM registered_phones
   GROUP BY phone
   HAVING COUNT(1) = 1
   

3. Потому что данный запрос сначала сделает подсчёт количества - составит таблицу из phone и count(phone), а потом пройдётся снова и выполнит DISTINCT, то есть удаление всех дубликатов (который будет бесполезен, т.к. мы используем агрегирующие функции и группировку):

   SELECT DISTINCT phone, COUNT(phone)
   FROM registered_phones
   GROUP BY phone;
   

   В этом случае надо использовать удаление дубликатов при подсчёте количества, то есть использовать COUNT(DISTINCT phone)