Почему не идет выборка из базы?

Вот решение. Надеюсь.

<?php 
    require_once 'ФАЙЛ_ПОДКЛЮЧЕНИЯ_К_БД.php'; //подключение к БД
    //$connection - это переменная с подключением. У вас, возможно, другая.
    //Получаем и упорядочиваем данные из БД
    $query = "SELECT prod.id, prod.id_specz FROM prod";
    $result = $connection->query($query);
    if (!$result) {die($connection->error);};
    $new_arr=[]; //массив с уже отстортированными данными
    while ($myrow = $result->fetch_array(MYSQLI_ASSOC)) {
        $id_specz=$myrow['id_specz'];
        if (iconv_strlen($id_specz)>1) {
            $d=explode(',', $id_specz); //режем строку по запятой
            sort($d); //спортируем знаечения по возрастанию
            $id_specz=implode(',', $d); //соединяем в строку
        }
        $new_arr[$myrow['id']]=$id_specz;
    };
    unset($result); //удаляем ненужное
    //Теперь обновим БД. Используем транзакцию, чтобы гарантировать запись.
    //Тут я использую одну для всей работы. Но если база большая, то лучше разбить на несколько частей и использовать подготовленные выражения (погуглите)
    $connection->autocommit(false); 
        foreach ($new_arr as $key => $value) {
            $query = "UPDATE prod SET id_specz = '$value' WHERE id = '$key'  LIMIT 1";
            $result = $connection->query($query);
            if (!$result) {die($connection->error);};
        }
    if (!$connection->commit()) {die($connection->error);};

    //Теперь у нас в БД всё упорядочено и приведено к единому виду. Можно с ними работать нормально.
    $want_to_find='1,2'; //ищем такую строку
    $query = "SELECT * FROM prod WHERE prod.id_specz = '$want_to_find'";
    $result = $connection->query($query);
    if (!$result) {die($connection->error);};
    while ($myrow = $result->fetch_array(MYSQLI_ASSOC)) {
        echo $myrow['id'].'<br>';
    };
?>

Если нужно искать все варианты (т.е. если вы хотите найти все записи, где есть 2 - например 1,2,3 или 1,2), то используйте

$query = "SELECT * FROM prod WHERE prod.id_specz SOUNDS LIKE '$want_to_find'";

Тут можно тогда не приводить к единому виду. Но лучше всё же привести.